1989 год 15 ноября
Заложен на ПО «Северное машиностроительное предприятие» в цехе №42 как экскурсионный подводный аппарат (ЭПА);

1990 год 18 сентября
Спущен на воду;

1991 год август
Проходил ходовые испытания в акватории Белого моря;

1991 год осень
Подписан приемный акт. Вступил в строй. Ответственный сдатчик - Авраменко В.Б., сдаточный механик - Шапошников А.В.;

1992 год октябрь
Доставлен судном "Стахановец Ермоленко" в порт Сент-Джонс государства Антигуа, расположенного на Малых Антильских островах в Карибском море;

1992 год 23 ноября
Совершил первый экскурсионный рейс;

1992 год - 1993 год
Совместно с судном обеспечения - буксиром "Евгений Егоров" проходил эксплуатационные испытания;

1996 год сентябрь
Доставлен на ПО "Северное машиностроительное предприятие" и поставлен на отстой;

1996 год - 2012 год
Находился на отстое в г.Северодвинск у цеха №42 ПО «Северное машиностроительное предприятие»;

2012 год - 2013 год
Выкуплен частным предпринимателем у ОАО "ПО "Севмаш" за 2,5 млн.рублей;

2013 год октябрь
Проводилась окраска корпуса и востановление внешнего вида;

2014 год лето
Был готов к реставрации внутренних помещений. После реставрации планировался к установке в качестве музея-кафе в г.Москва в 2015 году. Владелец занимался получением сертификата исторического наследия. Этим планам так и не довелось сбыться;

2016 год
Находился в г.Северодвинск на берегу гавани Святого Николая на территории предприятия «Спецфундаментстрой» после проведения значительного объема восстановительных работ;

2020 год
В 2020 году Вельский военно-морской клуб отпраздновал своё 20-летие. ЭПА "Нептун" стал подарком на его юбилей. По словам исполняющего обязанности председателя клуба Николая Дектерёва, нынешний владелец подводного аппарата — некоммерческое партнёрство «Спортивно-туристический клуб по организации отдыха, развлечений и спорта „Чемпион“» — таким образом ещё и отметил успехи вельчан в военно-патриотическом воспитании. Владельцы «Нептуна» думали куда его пристроить. Были варианты с перевозкой его в Санкт-Петербург и даже Евпаторию. И в итоге наши друзья из Кронштадтского Морского музея рассказали, что есть такой Вельский клуб ВМФ, к которому можно обратиться, — говорил о ЭПЛ Николай Дектерёв. В октябре 2020 года представители Вельского военно-морского клуба съездили в Северодвинск, где осмотрели ЭПА и встретились с представителями владельца. Затем было обсуждение судьбы аппарата с администрацией Вельска и Вельского района, по итогам которого решили, что подводный аппарат будет установлен в Вельске. По условиям договорённости с «Чемпионом», ЭПА нельзя будет использовать под объект общепита. Планируется, что если он всё-таки доберётся до Вельска, то в нём разместится военно-морской музей. ЭПА «Нептун», по словам Николая Дектерёва, всё ещё находится в собственности у «Чемпиона». Кроме того, согласно письмам, которая данная организация отправила в клуб и администрацию МО «Вельское», речь идёт о «совместном использовании» подводного аппарата;

2021 год 25 января
В Вельске подвели итоги общественных обсуждений по выбору территории для установки экскурсионной подводной лодки "Нептун". Как сообщает администрация Вельска, ЭПА займёт место за ТЦ «Аюта», у Вельского военно-морского клуба. На данный момент ЭПА, который Вельский военно-морской клуб получил в подарок на своё 20-летие, все еще находился в Северодвинске, на закрытой территории.